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Microbiota come predittore di mortalità nel trapianto di cellule ematopoietiche allogeniche

Le relazioni tra composizione del microbiota ed esiti clinici dopo trapianto allogenico di cellule ematopoietiche sono state descritte in studi condotti in singoli Centri.
Le variazioni geografiche nella composizione delle comunità microbiche umane e le differenze nelle pratiche cliniche tra i Centri sollevano la questione se queste associazioni siano generalizzabili.

La composizione del microbiota di campioni fecali ottenuti da pazienti sottoposti a trapianto allogenico di cellule ematopoietiche in quattro Centri è stata profilata mediante sequenziamento del gene 16S dell'RNA ribosomiale.
In uno studio osservazionale, sono state esaminate le associazioni tra diversità dei microbioti e mortalità usando l'analisi dei rischi proporzionali di Cox.

Per la stratificazione delle coorti in gruppi di diversità più alta e più alta, è stato utilizzato il valore di diversità mediana riscontrato nel Centro studi di New York.
Nell'analisi di coorti indipendenti, il Centro di New York era la coorte 1 e tre Centri in Germania, Giappone e Carolina del Nord costituivano la coorte 2.
La coorte 1 e i sottogruppi al suo interno sono stati analizzati per ulteriori esiti, inclusa la morte correlata al trapianto.

Sono stati profilati 8.767 campioni fecali ottenuti da 1.362 pazienti sottoposti a trapianto allogenico di cellule ematopoietiche nei quattro Centri.

Una maggiore diversità del microbiota intestinale è stata associata a un minore rischio di morte in coorti indipendenti ( coorte 1: 104 decessi tra 354 pazienti nel gruppo a più alta diversità rispetto a 136 decessi tra 350 pazienti nel gruppo a bassa diversità; hazard ratio aggiustato, aHR=0.71; coorte 2: 18 decessi tra 87 pazienti nel gruppo a più alta diversità rispetto a 35 decessi tra 92 pazienti nel gruppo a bassa diversità; aHR=0.49 ).

Le analisi dei sottogruppi hanno identificato una associazione tra bassa diversità intestinale e maggiori rischi di morte per trapianto e morte attribuibile alla malattia del trapianto contro l'ospite.

I campioni basali ottenuti prima del trapianto avevano già mostrato evidenza di perturbazione del microbioma e una minore diversità prima del trapianto che era associata a una ridotta sopravvivenza.

I modelli di perturbazione del microbiota durante il trapianto allogenico di cellule ematopoietiche sono stati simili tra i Centri di trapianto e le aree geografiche; i modelli erano caratterizzati da perdita di diversità e dominio da parte dei singoli taxa.
Una maggiore diversità del microbiota intestinale al momento dell'attecchimento dei neutrofili è stata associata a una più bassa mortalità. ( Xagena2020 )

Peled JU et al, N Engl J Med 2020; 382: 822-834

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